15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3840 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3840  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  353  8.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223195  normal  0.195443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0690  hypothetical protein  68.1 
 
 		 166 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3037  hypothetical protein  63.8 
 
 		 172 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0421  protein of unknown function DUF1486  65.03 
 
 		 166 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.378501  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1614  hypothetical protein  38.14 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  29.38 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  28.8 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  29.27 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  26.25 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  29.41 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  27.56 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  27.97 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  28.69 
 
 		 163 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>