29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1255 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  324  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  92.62 
 
 
160 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  66.88 
 
 
157 aa  208  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  63.64 
 
 
157 aa  207  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  63.52 
 
 
159 aa  206  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  64.97 
 
 
163 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  63.87 
 
 
156 aa  204  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  64.29 
 
 
157 aa  204  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  65.58 
 
 
157 aa  203  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  65.58 
 
 
157 aa  203  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  65.58 
 
 
157 aa  203  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  61.54 
 
 
156 aa  200  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  60.9 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  58.97 
 
 
158 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  58.97 
 
 
158 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  63.51 
 
 
174 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  61.54 
 
 
163 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  49.02 
 
 
156 aa  168  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  56.25 
 
 
165 aa  160  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  48.72 
 
 
162 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  48.43 
 
 
171 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  39.86 
 
 
158 aa  138  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  47.1 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  50.31 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3840  hypothetical protein  29.27 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223195  normal  0.195443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  29.92 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  25.86 
 
 
130 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  27.27 
 
 
134 aa  40.8  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>