25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2583 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  333  5.999999999999999e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  45.45 
 
 
163 aa  161  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  44.37 
 
 
159 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  43.71 
 
 
157 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  42.48 
 
 
157 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  42.48 
 
 
157 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  42.48 
 
 
157 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  41.38 
 
 
160 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  42.25 
 
 
158 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  42.95 
 
 
157 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  42.48 
 
 
174 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  39.86 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  42.96 
 
 
158 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  42.57 
 
 
156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  42.25 
 
 
158 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  40.79 
 
 
156 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  41.83 
 
 
163 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  45.21 
 
 
156 aa  130  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  38.93 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  38.85 
 
 
171 aa  104  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  35.4 
 
 
165 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  38.89 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  38.06 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  32.7 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>