34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1514 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  100 
 
 		 126 aa  255  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3596  nuclear transport factor 2  47.5 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3765  nuclear transport factor 2  42.28 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581539  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  47.32 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4139  nuclear transport factor 2  46.55 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4214  nuclear transport factor 2  46.55 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4370  nuclear transport factor 2  46.55 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0442394  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2053  nuclear transport factor 2  45.13 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4664  nuclear transport factor 2  43.36 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4817  steroid delta-isomerase  36.52 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  40.65 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2174  nuclear transport factor 2  31.71 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  33.94 
 
 		 159 aa  52  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3259  protein of unknown function DUF1486  24.56 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0164408  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  44.78 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  45.61 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4546  hypothetical protein  33.85 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  24.04 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  44.78 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  43.28 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  28.69 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  33.66 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10775  hypothetical protein  32.76 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  40.3 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  22.73 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4674  nuclear transport factor 2  28.81 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4586  nuclear transport factor 2  28.81 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5024  hypothetical protein  46.43 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  41.79 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  27.05 
 
 		 162 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  47.73 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  54.76 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  27.97 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>