22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4985 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  100 
 
 
127 aa  261  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  44.8 
 
 
135 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3259  protein of unknown function DUF1486  40.62 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0164408  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0042  protein of unknown function DUF1486  30.77 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  30.83 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  24.59 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2520  hypothetical protein  23.53 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219505  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  28.1 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2441  hypothetical protein  27.45 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.655393  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2174  nuclear transport factor 2  25.83 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  20.39 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4674  nuclear transport factor 2  27.01 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4586  nuclear transport factor 2  27.01 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  26.27 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  22.73 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2097  hypothetical protein  26.36 
 
 
518 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  26.55 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  26.28 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3596  nuclear transport factor 2  23.08 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4664  nuclear transport factor 2  29.6 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  26.13 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3969  hypothetical protein  24.58 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>