16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2031 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  100 
 
 
135 aa  280  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  44.8 
 
 
127 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3259  protein of unknown function DUF1486  27.34 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0164408  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2441  hypothetical protein  25.64 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.655393  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3969  hypothetical protein  24.06 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  24.04 
 
 
126 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  21.19 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2520  hypothetical protein  22.94 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219505  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  22.31 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  29.13 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  24.14 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4817  steroid delta-isomerase  22.31 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  20.63 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  19.81 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  20 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  19.81 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>