22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3295 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  100 
 
 		 122 aa  244  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3765  nuclear transport factor 2  64.52 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  47.32 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2174  nuclear transport factor 2  37.17 
 
 		 123 aa  84.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  40.54 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4817  steroid delta-isomerase  35 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4664  nuclear transport factor 2  35.59 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2053  nuclear transport factor 2  34.75 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4139  nuclear transport factor 2  36.61 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4214  nuclear transport factor 2  36.61 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4370  nuclear transport factor 2  36.61 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0442394  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3596  nuclear transport factor 2  35.04 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03450  ketosteroid isomerase-like protein  50 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.509456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  28.1 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12079  hypothetical protein  47.06 
 
 		 265 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  29.84 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  24.14 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2520  hypothetical protein  28.57 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3431  nuclear transport factor 2  55.88 
 
 		 267 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3259  protein of unknown function DUF1486  29.69 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0164408  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  28.33 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3185  nuclear transport factor 2  62.07 
 
 		 268 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572325  normal  0.409809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>