18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3185 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3185  nuclear transport factor 2  100 
 
 
268 aa  527  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572325  normal  0.409809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3431  nuclear transport factor 2  66.92 
 
 
267 aa  337  8e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12079  hypothetical protein  46.97 
 
 
265 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2888  nuclear transport factor 2  47.74 
 
 
274 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0754079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2932  nuclear transport factor 2  47.74 
 
 
274 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2918  nuclear transport factor 2  47.74 
 
 
274 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3803  hypothetical protein  40.78 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2441  hypothetical protein  38.33 
 
 
133 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.655393  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  41.54 
 
 
144 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4586  nuclear transport factor 2  26.81 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  30.19 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4674  nuclear transport factor 2  26.81 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10775  hypothetical protein  35.71 
 
 
139 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  26.76 
 
 
143 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3969  hypothetical protein  26.47 
 
 
149 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  38.1 
 
 
143 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  44.9 
 
 
122 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  29.27 
 
 
136 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>