17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12079 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12079  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  534  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2932  nuclear transport factor 2  47.08 
 
 
274 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2918  nuclear transport factor 2  47.08 
 
 
274 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2888  nuclear transport factor 2  47.08 
 
 
274 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0754079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3431  nuclear transport factor 2  46.24 
 
 
267 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3185  nuclear transport factor 2  46.97 
 
 
268 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572325  normal  0.409809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3803  hypothetical protein  40.36 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  33.01 
 
 
147 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  33.64 
 
 
124 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10775  hypothetical protein  27.54 
 
 
139 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  28.24 
 
 
143 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  29.77 
 
 
144 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4586  nuclear transport factor 2  27.74 
 
 
143 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4674  nuclear transport factor 2  27.74 
 
 
143 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  47.06 
 
 
122 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  27.21 
 
 
143 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  30.08 
 
 
136 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>