16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3765 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3765  nuclear transport factor 2  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581539  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  64.52 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  42.28 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  38.74 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2174  nuclear transport factor 2  35.4 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4664  nuclear transport factor 2  35.48 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4139  nuclear transport factor 2  36.67 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4214  nuclear transport factor 2  36.67 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4370  nuclear transport factor 2  36.67 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0442394  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2053  nuclear transport factor 2  34.4 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4817  steroid delta-isomerase  30.51 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3596  nuclear transport factor 2  32.48 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2520  hypothetical protein  30.51 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3969  hypothetical protein  31.3 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3259  protein of unknown function DUF1486  28.46 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0164408  normal  0.250865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>