21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3596 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3596  nuclear transport factor 2  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  47.5 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4817  steroid delta-isomerase  33.86 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  35.04 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  35 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2053  nuclear transport factor 2  32.2 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4139  nuclear transport factor 2  32.48 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4214  nuclear transport factor 2  32.48 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3765  nuclear transport factor 2  32.48 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4664  nuclear transport factor 2  30.51 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4370  nuclear transport factor 2  32.48 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0442394  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2174  nuclear transport factor 2  25.66 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37150  hypothetical protein  31.71 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00435317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3259  protein of unknown function DUF1486  26.23 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0164408  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  30.36 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  23.08 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  27.07 
 
 		 143 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10775  hypothetical protein  30.6 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2520  hypothetical protein  29.73 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  29.46 
 
 		 144 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>