More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0932 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0932  putative CheW protein  100 
 
 		 151 aa  290  6e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.432309  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0691  putative CheW protein  59.31 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  54.29 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  54.29 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  42.22 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  39.57 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  38.85 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  35.66 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  34.06 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  31.51 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  33.57 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  29.53 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  30.71 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  30.99 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.69 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  32.17 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  31.47 
 
 		 301 aa  68.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  30.28 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  30.34 
 
 		 533 aa  67.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  30.28 
 
 		 302 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  31.88 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  31.88 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  30.28 
 
 		 302 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.94 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  30.28 
 
 		 302 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  30.28 
 
 		 302 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  30.28 
 
 		 302 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  30.28 
 
 		 302 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  31.03 
 
 		 170 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  30.28 
 
 		 302 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  34.75 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  29.37 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.94 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  30 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  28.87 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  36.46 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  31.65 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  27.86 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  29.05 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.14 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  36.46 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  26.62 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  40.66 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  31.34 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0776  CheW protein  27.33 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.01614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  32.37 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  32.61 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  28.57 
 
 		 907 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  34 
 
 		 518 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  35.42 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  31.16 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  32.62 
 
 		 478 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  30.43 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.57 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  31.88 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.57 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  27.14 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  29.29 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  23.19 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  30.07 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  29.2 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  30.22 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30.5 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  35.05 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  30.99 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  29.2 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  39.58 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  26.43 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  29.2 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  26.43 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  30.43 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2578  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.36 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1571  CheW-like domain-containing protein  29.23 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.603726  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  27.66 
 
 		 301 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  29.25 
 
 		 308 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  27.27 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  32.39 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  25.18 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  32.84 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  31.3 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  26.53 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  31.11 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  30.66 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  29.29 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  27.27 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  28.87 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  25.9 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  29.22 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  31.47 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  27.89 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  27.01 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  28.21 
 
 		 312 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  31.08 
 
 		 324 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  31.58 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  29.1 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  30.77 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  28.97 
 
 		 302 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  29.41 
 
 		 320 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  27.01 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>