More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1055 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  100 
 
 		 312 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  59.45 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  60.29 
 
 		 336 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  59.93 
 
 		 336 aa  346  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  59.78 
 
 		 336 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  56.54 
 
 		 333 aa  344  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  56.04 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  53.02 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  52.67 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  52.67 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  53.38 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  54.15 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.01 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  51.86 
 
 		 314 aa  322  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.02 
 
 		 310 aa  322  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  53.74 
 
 		 312 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  51.19 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  51.66 
 
 		 311 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  51.19 
 
 		 312 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  51.66 
 
 		 311 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  51.19 
 
 		 312 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.28 
 
 		 310 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.28 
 
 		 310 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  51.66 
 
 		 311 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  51.19 
 
 		 312 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.32 
 
 		 311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  51.19 
 
 		 312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.69 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  51.6 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  52.67 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  53.08 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  52.05 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.33 
 
 		 310 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.81 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.74 
 
 		 315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  52.74 
 
 		 315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.74 
 
 		 315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.74 
 
 		 315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.74 
 
 		 315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.74 
 
 		 315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.74 
 
 		 315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.16 
 
 		 304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.74 
 
 		 315 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.86 
 
 		 312 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  50.84 
 
 		 303 aa  309  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.31 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  52.26 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  51.69 
 
 		 308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  52.25 
 
 		 310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  50.34 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.61 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  51.9 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  51.56 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.33 
 
 		 303 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.33 
 
 		 305 aa  301  9e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  50.7 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  45.82 
 
 		 314 aa  300  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  51.68 
 
 		 304 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.68 
 
 		 304 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  52.11 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  44.97 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  45.82 
 
 		 308 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  46.71 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  44.67 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.33 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.33 
 
 		 311 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.33 
 
 		 311 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.33 
 
 		 311 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  45.03 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  44.48 
 
 		 311 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  44.48 
 
 		 311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  44.48 
 
 		 311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  44.48 
 
 		 311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  44.15 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  47.57 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  51.94 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.31 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  46.23 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  46.23 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.63 
 
 		 316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  46.18 
 
 		 427 aa  266  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  44.84 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  45.61 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  48.08 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  40.75 
 
 		 319 aa  225  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  38.46 
 
 		 319 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.93 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.77 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  38.72 
 
 		 336 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  38.46 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  38.54 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  38.08 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  37.12 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  37.12 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  40.74 
 
 		 314 aa  209  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  37.94 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  35.43 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.31 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  34.98 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  34.98 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>