More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1861 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  100 
 
 
443 aa  845    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  39.86 
 
 
432 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  39.76 
 
 
424 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  40.52 
 
 
426 aa  250  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0363  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 
455 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3423  enterobactin exporter EntS  35.94 
 
 
422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408147  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0689  enterobactin exporter EntS  34.27 
 
 
414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.38667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0632  enterobactin exporter EntS  35.05 
 
 
414 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0705  enterobactin exporter EntS  35.05 
 
 
414 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1123  enterobactin exporter EntS  34.29 
 
 
415 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115316  normal  0.860817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0751  enterobactin exporter EntS  34.78 
 
 
414 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0646  enterobactin exporter EntS  34.51 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0493  enterobactin exporter EntS  35.16 
 
 
416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00558  predicted transporter  34.89 
 
 
416 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3035  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 
416 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3053  enterobactin exporter EntS  34.89 
 
 
416 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00547  hypothetical protein  34.89 
 
 
416 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0642  enterobactin exporter EntS  34.89 
 
 
416 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0611  enterobactin exporter EntS  34.89 
 
 
416 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0611  enterobactin exporter EntS  34.89 
 
 
416 aa  172  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0676  enterobactin exporter EntS  34.89 
 
 
416 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565934  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  30.32 
 
 
420 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  31.58 
 
 
443 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  32.6 
 
 
415 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 
422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
426 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  31.82 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  29.63 
 
 
404 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  33.09 
 
 
524 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  29.63 
 
 
404 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  32.66 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
423 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  31.37 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  28.4 
 
 
419 aa  127  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
432 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
432 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  25.31 
 
 
424 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 
408 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  30.07 
 
 
499 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  31.23 
 
 
415 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  33.57 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  28.24 
 
 
407 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.58 
 
 
419 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  24.57 
 
 
427 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  32.89 
 
 
430 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 
443 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
428 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  32.84 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.85 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  32.76 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
412 aa  114  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
412 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  31.31 
 
 
412 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
406 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  32.59 
 
 
406 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  31.65 
 
 
403 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  28.1 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  30.39 
 
 
423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  28.91 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
432 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
445 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
440 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  29.03 
 
 
420 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  30.96 
 
 
411 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  25.69 
 
 
427 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 
422 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  31.04 
 
 
403 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  29.19 
 
 
426 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  26.6 
 
 
399 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  30.25 
 
 
553 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  30.08 
 
 
416 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  30.57 
 
 
431 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
426 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.46 
 
 
447 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  30.87 
 
 
413 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  32.42 
 
 
424 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
438 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  25.78 
 
 
421 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  30.79 
 
 
416 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.91 
 
 
436 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  28.4 
 
 
403 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
415 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  30.68 
 
 
360 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  30.79 
 
 
416 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  29.13 
 
 
474 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  30.27 
 
 
416 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  30.27 
 
 
416 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
406 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  30.27 
 
 
416 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
440 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 
479 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>