More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0056 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  100 
 
 
742 aa  1472    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  58.13 
 
 
547 aa  324  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  58.6 
 
 
870 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  55.99 
 
 
557 aa  306  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  51.53 
 
 
1163 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  51.36 
 
 
1363 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  50.96 
 
 
687 aa  295  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  50.9 
 
 
947 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  49.39 
 
 
696 aa  284  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  53.93 
 
 
618 aa  283  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  49.82 
 
 
1364 aa  280  5e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  51.6 
 
 
535 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.11 
 
 
664 aa  277  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  45.68 
 
 
1652 aa  275  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  47.18 
 
 
820 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  55.68 
 
 
644 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  51.64 
 
 
716 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  51.27 
 
 
608 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.67 
 
 
642 aa  265  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  53.93 
 
 
1357 aa  263  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  56.78 
 
 
597 aa  263  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  49.43 
 
 
542 aa  257  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.38 
 
 
677 aa  257  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.71 
 
 
676 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  43.75 
 
 
1236 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  43.37 
 
 
1474 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.18 
 
 
612 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  46.59 
 
 
1193 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  47.02 
 
 
1221 aa  253  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  48.28 
 
 
528 aa  253  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  50 
 
 
637 aa  253  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  44.44 
 
 
1831 aa  250  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  47.27 
 
 
1523 aa  250  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  48.56 
 
 
434 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
421 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  48.08 
 
 
555 aa  249  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  44.73 
 
 
870 aa  248  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  52.02 
 
 
716 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  53.14 
 
 
620 aa  248  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  47.33 
 
 
1557 aa  248  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  48.3 
 
 
771 aa  247  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  43.66 
 
 
1247 aa  247  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.73 
 
 
930 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  47.08 
 
 
680 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  43.66 
 
 
1878 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  48.76 
 
 
522 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  45.36 
 
 
550 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  40.3 
 
 
1188 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  47.67 
 
 
1454 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  51.89 
 
 
837 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  40.87 
 
 
1196 aa  243  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.59 
 
 
569 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 
548 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
604 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4116  serine/threonine protein kinase  59.09 
 
 
514 aa  242  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  46.77 
 
 
608 aa  242  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  49.25 
 
 
573 aa  242  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
594 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.14 
 
 
740 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  49.82 
 
 
1553 aa  241  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  43.15 
 
 
317 aa  240  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.86 
 
 
520 aa  240  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
638 aa  240  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.01 
 
 
644 aa  239  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  45.8 
 
 
1190 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  47.53 
 
 
630 aa  238  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  47.21 
 
 
589 aa  238  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.35 
 
 
585 aa  237  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.71 
 
 
682 aa  237  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  45.05 
 
 
623 aa  237  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  47.94 
 
 
514 aa  236  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  48.03 
 
 
569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  47.47 
 
 
586 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  46.76 
 
 
1443 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.83 
 
 
599 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  43.17 
 
 
316 aa  233  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4894  serine/threonine protein kinase  48.47 
 
 
558 aa  232  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  48.69 
 
 
624 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  40.71 
 
 
455 aa  231  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  47.33 
 
 
613 aa  231  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.72 
 
 
630 aa  230  8e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  42.65 
 
 
316 aa  230  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.83 
 
 
751 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  56.86 
 
 
790 aa  229  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  45.64 
 
 
344 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
589 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  48.08 
 
 
612 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  47.12 
 
 
1481 aa  229  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  44.63 
 
 
344 aa  229  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5095  serine/threonine protein kinase  49.03 
 
 
585 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0160466  normal  0.222813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  46.97 
 
 
551 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  44.15 
 
 
637 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  42.76 
 
 
1262 aa  227  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  47.27 
 
 
806 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.91 
 
 
1686 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.63 
 
 
600 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2699  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
743 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0467419  normal  0.85773 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  43.17 
 
 
316 aa  226  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  43.53 
 
 
316 aa  225  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.75 
 
 
576 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>