84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3185 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3185  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  100 
 
 		 168 aa  345  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0138929  normal  0.0807912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1502  single-strand binding protein  56.31 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2046  single-strand binding protein  57.84 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377455  normal  0.610609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3208  single-strand binding protein  54.95 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2913  single-strand binding protein  54.95 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0079  hypothetical protein  41.32 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.998813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3883  single-strand-binding protein  53 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0526  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  47.12 
 
 		 219 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0687  hypothetical protein  43.69 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07371  single-stranded DNA-binding protein  43.69 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1835  single-stranded DNA-binding protein  44.66 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1671  hypothetical protein  42.57 
 
 		 168 aa  100  8e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05601  single-stranded DNA-binding protein  44.12 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0125633  normal  0.367261 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05291  single-stranded DNA-binding protein  38.71 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05591  single-stranded DNA-binding protein  41 
 
 		 141 aa  94.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0503  hypothetical protein  41 
 
 		 141 aa  94.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05661  single-stranded DNA-binding protein  41 
 
 		 149 aa  90.9  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.621849  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05021  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.170532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  33.66 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  32 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  35 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  29.84 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  26.98 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  28.44 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  28.87 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  30 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  29.11 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  31 
 
 		 156 aa  50.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  32 
 
 		 136 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  28 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  31 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4671  single-strand binding protein  30.15 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.726649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  31.73 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  34.12 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  31.73 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  26.32 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  26.81 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  25.68 
 
 		 301 aa  47.8  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  29.59 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  27.62 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  31 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  28.03 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  25.45 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  25.89 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  28.03 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  28.87 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  28.43 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  26.38 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  29.7 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  28.43 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  29 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  28.04 
 
 		 152 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  23.13 
 
 		 160 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  29 
 
 		 167 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  25.3 
 
 		 150 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  25.3 
 
 		 150 aa  42  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  25.62 
 
 		 141 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3562  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  27.72 
 
 		 225 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  32 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  26.32 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  29.76 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  29.81 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  25.38 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  27.45 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  26.97 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  23.81 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  29.59 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  25.32 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  26.67 
 
 		 143 aa  40.8  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  29 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  26.47 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  27.45 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  25.6 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  29 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  26.47 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  26.47 
 
 		 157 aa  40.8  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  29 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>