More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0060 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0060  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
330 aa  679    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3750  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.61 
 
 
326 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.677128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2717  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.11 
 
 
327 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3696  putative sulfite oxidase subunit YedY  63 
 
 
326 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0157  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.72 
 
 
321 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.337145 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.9 
 
 
331 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2723  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.54 
 
 
325 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.32 
 
 
333 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.28 
 
 
319 aa  293  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.08 
 
 
331 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.34 
 
 
331 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.65 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.65 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.65 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.65 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.65 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2142  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.53 
 
 
330 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.48 
 
 
311 aa  285  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.39 
 
 
333 aa  285  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.92 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.79 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.01 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.69 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.79 
 
 
331 aa  282  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.39 
 
 
331 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.73 
 
 
324 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.51 
 
 
366 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.21 
 
 
331 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.45 
 
 
331 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.21 
 
 
366 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.21 
 
 
366 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.08 
 
 
331 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1758  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.04 
 
 
325 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5829  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.54 
 
 
324 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.91 
 
 
331 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.29 
 
 
333 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0560  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.01 
 
 
317 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0505928  normal  0.0124744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.73 
 
 
331 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.61 
 
 
331 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.07 
 
 
334 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.38 
 
 
333 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.78 
 
 
334 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.69 
 
 
334 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.99 
 
 
334 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.99 
 
 
334 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.69 
 
 
334 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.82 
 
 
344 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.69 
 
 
334 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.35 
 
 
337 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.82 
 
 
331 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  44.48 
 
 
334 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.48 
 
 
334 aa  275  8e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.48 
 
 
334 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  44.48 
 
 
334 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.48 
 
 
334 aa  275  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  45.78 
 
 
337 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.48 
 
 
334 aa  275  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.11 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.48 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.48 
 
 
336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0627  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.27 
 
 
322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000395521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.95 
 
 
331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.37 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.87 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.91 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.41 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.19 
 
 
319 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.91 
 
 
344 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.54 
 
 
337 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.43 
 
 
313 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.19 
 
 
319 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.98 
 
 
340 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.39 
 
 
345 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.02 
 
 
302 aa  272  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.74 
 
 
341 aa  271  9e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.72 
 
 
340 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.6 
 
 
332 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.07 
 
 
344 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.93 
 
 
328 aa  270  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.6 
 
 
332 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.83 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.54 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.11 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.06 
 
 
310 aa  269  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.78 
 
 
344 aa  269  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.86 
 
 
313 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.11 
 
 
335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.86 
 
 
313 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.77 
 
 
317 aa  268  8e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.03 
 
 
344 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.08 
 
 
336 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.17 
 
 
316 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.45 
 
 
332 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.65 
 
 
319 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.6 
 
 
336 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.85 
 
 
322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2123  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.2 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2345  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.14 
 
 
347 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.89 
 
 
331 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.64 
 
 
338 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>