More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1701 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  70.99 
 
 
861 aa  1208  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  65.2 
 
 
862 aa  1092  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  73.85 
 
 
845 aa  1251  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  63.8 
 
 
916 aa  1081  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  71.85 
 
 
881 aa  1245  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
906 aa  1125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  100 
 
 
846 aa  1704  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  70.49 
 
 
876 aa  1182  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
855 aa  897  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 
877 aa  1092  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 
873 aa  1061  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  64.94 
 
 
871 aa  1066  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  66.71 
 
 
901 aa  1103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 
895 aa  1061  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 
885 aa  1057  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  56.34 
 
 
925 aa  970  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  64.62 
 
 
860 aa  1102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 
903 aa  1146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  70.6 
 
 
858 aa  1183  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  76.13 
 
 
836 aa  1270  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 
902 aa  1093  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 
911 aa  1003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  61.83 
 
 
872 aa  1062  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.23734e-08 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 
894 aa  1068  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  67.93 
 
 
886 aa  1153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
808 aa  600  1e-170  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
802 aa  599  1e-170  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
864 aa  598  1e-169  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
896 aa  536  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
928 aa  527  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
892 aa  513  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
908 aa  507  1e-142  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
905 aa  493  1e-138  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
863 aa  467  1e-130  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
886 aa  453  1e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
864 aa  451  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
886 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
855 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
865 aa  449  1e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
886 aa  447  1e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
863 aa  443  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
865 aa  439  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
886 aa  434  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 
906 aa  435  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  34 
 
 
809 aa  431  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 
858 aa  431  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
865 aa  424  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
869 aa  425  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
799 aa  403  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
799 aa  402  1e-110  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  6.48947e-14 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
799 aa  397  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  33.37 
 
 
799 aa  391  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 
771 aa  383  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
877 aa  375  1e-102  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 
816 aa  368  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 
806 aa  367  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  5.60387e-08  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 
808 aa  356  8e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
877 aa  306  8e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 
882 aa  305  2e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.29696e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 
891 aa  304  5e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 
911 aa  303  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 
872 aa  302  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 
882 aa  301  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 
893 aa  299  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  29.99 
 
 
883 aa  299  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 
885 aa  296  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 
861 aa  294  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
881 aa  293  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.51158e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
882 aa  292  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  30.76 
 
 
881 aa  292  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1688  valyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 
902 aa  292  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.524019 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
880 aa  291  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.20164e-05  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 
903 aa  291  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 
904 aa  290  5e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12474  valyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 
876 aa  290  6e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
883 aa  289  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
883 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3631  valyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
883 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
882 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1495  valyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 
899 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280307  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 
872 aa  289  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3563  valyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
883 aa  289  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
883 aa  288  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 
879 aa  288  4e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 
930 aa  287  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2630  valyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 
900 aa  286  1e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395848  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 
881 aa  286  1e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 
1006 aa  285  2e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2239  valyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
868 aa  285  3e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659246  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 
881 aa  285  4e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5994  valyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 
874 aa  284  5e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298309  normal  0.0937262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
881 aa  283  7e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 
957 aa  283  8e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
881 aa  283  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 
892 aa  283  9e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 
903 aa  283  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
881 aa  283  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 
912 aa  283  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
881 aa  283  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 
879 aa  282  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>