More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0221 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  93.97 
 
 		 116 aa  217  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  88.89 
 
 		 115 aa  190  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  85.19 
 
 		 117 aa  184  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  80.18 
 
 		 117 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  77.48 
 
 		 113 aa  174  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  75.68 
 
 		 113 aa  167  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  75.68 
 
 		 113 aa  166  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  75.68 
 
 		 113 aa  163  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  69.52 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  67.59 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  46.09 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  56.76 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  57.41 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  51.85 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  44.34 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  39.25 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  45.63 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  45.28 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  36.45 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  37.23 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.96 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.17 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  41.05 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  41.05 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.17 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  41.05 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.17 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.17 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  35.11 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  34.04 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.04 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  34.65 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  33.03 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.41 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  36.04 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  34.65 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  35.4 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  33.94 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  34.44 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  28.32 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  40.38 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  29.59 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  28.97 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  28.97 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  34.26 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  31.48 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  31.53 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  31.13 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  30.7 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  30.7 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.04 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  30.7 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  30.7 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>