More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0006 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  57.63 
 
 
648 aa  698  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  67.41 
 
 
685 aa  847  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  56.57 
 
 
650 aa  716  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.73734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  57.23 
 
 
645 aa  681  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  53.29 
 
 
651 aa  663  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  58.67 
 
 
641 aa  724  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 
656 aa  674  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  58.6 
 
 
636 aa  681  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  66.77 
 
 
675 aa  879  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  53.1 
 
 
637 aa  691  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  57.03 
 
 
642 aa  687  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  56.48 
 
 
638 aa  684  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  67.66 
 
 
675 aa  887  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  73.68 
 
 
719 aa  922  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  59.38 
 
 
642 aa  728  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  65.27 
 
 
695 aa  848  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.1906e-14 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  53.41 
 
 
646 aa  669  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  58.42 
 
 
640 aa  703  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  66.37 
 
 
720 aa  862  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  51.93 
 
 
651 aa  663  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  58.59 
 
 
650 aa  697  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  65.17 
 
 
696 aa  851  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  60.93 
 
 
628 aa  775  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  53.38 
 
 
658 aa  657  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  71.82 
 
 
654 aa  921  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  57.16 
 
 
637 aa  716  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  70.56 
 
 
666 aa  908  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 
659 aa  677  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  71.23 
 
 
661 aa  913  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  54.8 
 
 
643 aa  674  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  61.31 
 
 
711 aa  753  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  57.1 
 
 
647 aa  686  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  66.77 
 
 
675 aa  879  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  69.47 
 
 
657 aa  904  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  66.77 
 
 
675 aa  880  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  54.73 
 
 
652 aa  679  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  55.11 
 
 
642 aa  672  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  55.62 
 
 
645 aa  642  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  61.4 
 
 
794 aa  650  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  56.26 
 
 
640 aa  686  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  51.59 
 
 
650 aa  650  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  54.75 
 
 
649 aa  669  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  54.85 
 
 
644 aa  687  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  1.55334e-06 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  54.63 
 
 
653 aa  676  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  54.56 
 
 
644 aa  685  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  51.4 
 
 
651 aa  658  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  61.75 
 
 
696 aa  792  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  59.74 
 
 
802 aa  637  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  55.33 
 
 
643 aa  680  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  56.5 
 
 
640 aa  729  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  55.13 
 
 
636 aa  689  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0006  DNA gyrase subunit B  71.69 
 
 
652 aa  872  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  55.11 
 
 
635 aa  685  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  60.12 
 
 
633 aa  742  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.95632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  57.47 
 
 
642 aa  687  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  51.32 
 
 
654 aa  635  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.39989e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  56.79 
 
 
635 aa  689  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  56.41 
 
 
640 aa  689  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  52.35 
 
 
665 aa  677  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  54.98 
 
 
636 aa  689  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.63706e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  57.12 
 
 
640 aa  684  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  54.25 
 
 
636 aa  684  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  54.08 
 
 
649 aa  638  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  58.89 
 
 
644 aa  736  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  54.48 
 
 
645 aa  671  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  51.32 
 
 
654 aa  636  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  66.32 
 
 
714 aa  892  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  52.78 
 
 
627 aa  643  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  57.12 
 
 
640 aa  684  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  56.26 
 
 
640 aa  686  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  65.3 
 
 
686 aa  808  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  56.41 
 
 
640 aa  687  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  56.41 
 
 
640 aa  684  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  51.16 
 
 
654 aa  635  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  56.11 
 
 
640 aa  681  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  56.26 
 
 
640 aa  686  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  51.46 
 
 
635 aa  637  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  55.51 
 
 
644 aa  671  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  56.57 
 
 
640 aa  687  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  51.32 
 
 
654 aa  636  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  78.21 
 
 
661 aa  1004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  56.94 
 
 
643 aa  715  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  58.71 
 
 
633 aa  727  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0010  DNA gyrase, B subunit  65.93 
 
 
680 aa  839  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  56.86 
 
 
644 aa  706  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  60.29 
 
 
795 aa  637  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  54.91 
 
 
644 aa  661  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  51.37 
 
 
655 aa  639  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  55.02 
 
 
637 aa  671  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  52.41 
 
 
655 aa  637  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  60.11 
 
 
795 aa  635  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0005  DNA gyrase, B subunit  59.38 
 
 
808 aa  672  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  62.2 
 
 
691 aa  799  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  51.32 
 
 
654 aa  636  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.3182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  56.26 
 
 
640 aa  686  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  54.35 
 
 
645 aa  679  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0006  DNA gyrase, B subunit  77.43 
 
 
645 aa  998  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0161215 
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.33 
 
 
642 aa  667  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  61.03 
 
 
795 aa  645  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  53.4 
 
 
654 aa  668  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>