More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2518 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
411 aa  819    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  74.25 
 
 
417 aa  595  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  51.76 
 
 
415 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  57.4 
 
 
425 aa  388  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  52.42 
 
 
413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  38.82 
 
 
439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  39.9 
 
 
409 aa  207  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 
417 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
398 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  37.46 
 
 
388 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2071  glycosyl transferase, group 1  35.82 
 
 
391 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637859  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
394 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.59 
 
 
401 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
409 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
396 aa  146  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
401 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.77 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
394 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
421 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
374 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
386 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
395 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
409 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
434 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
410 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
396 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
390 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
396 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
381 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
438 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  35.78 
 
 
408 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  41.82 
 
 
426 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  28.93 
 
 
358 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
448 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
385 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
378 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
403 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
378 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
422 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 
369 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
426 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 
770 aa  99.8  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  31.25 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
390 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
455 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  36.46 
 
 
349 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
672 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
414 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.74 
 
 
419 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
439 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
439 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
375 aa  96.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
397 aa  96.7  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
453 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
440 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  37.56 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
439 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.65 
 
 
423 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
364 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
438 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.07 
 
 
388 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  33.14 
 
 
360 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
436 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
369 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
402 aa  94.4  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
435 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
402 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
364 aa  93.6  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 
419 aa  93.6  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
384 aa  93.6  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
438 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  29.3 
 
 
450 aa  93.2  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
387 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
350 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
391 aa  92.8  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
425 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.21 
 
 
650 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
398 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
402 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
430 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>