More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0779 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 		 183 aa  244  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 183 aa  242  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  59.12 
 
 		 183 aa  238  4e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 185 aa  238  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  237  9e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  237  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  237  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  59.44 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 178 aa  235  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0501  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 182 aa  234  4e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  233  8e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 220 aa  233  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  58.1 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 223 aa  232  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2313  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000920139  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000334346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 184 aa  230  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3983  ribosomal protein L5  57.69 
 
 		 184 aa  230  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  230  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1034  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000106866  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  54.75 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 184 aa  226  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 184 aa  226  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 180 aa  225  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0288  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152111  normal  0.01295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  54.75 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0279  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000228598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3792  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0743065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2620  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0483122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  57.14 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3734  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000331998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1936  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000916993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3157  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000127372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3490  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  56.11 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 		 185 aa  223  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000312511  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  223  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>