More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0644 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 245 aa  496  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  59.66 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  60.08 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  55.83 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0478  ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  59 
 
 		 243 aa  288  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  56.25 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  59.41 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  54.58 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  58.92 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  59.17 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  56.72 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  58.92 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  59.17 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  58.8 
 
 		 246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  58.4 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  53.75 
 
 		 241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  59.17 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  59.49 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  62.34 
 
 		 254 aa  281  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  57.56 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  57.55 
 
 		 333 aa  281  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  56.61 
 
 		 311 aa  281  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  57.5 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  57.5 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  58.05 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  55.83 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.83 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 		 332 aa  278  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.79 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  55.6 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  57.14 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 		 241 aa  277  9e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  54.58 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  54.58 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  53.75 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 		 336 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  57.98 
 
 		 247 aa  275  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  56.72 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  56.72 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  56.72 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  56.72 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  57.74 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  54.17 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  56.72 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  56.3 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  56.3 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  56.3 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 		 243 aa  275  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  54.1 
 
 		 253 aa  274  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.58 
 
 		 241 aa  274  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  53.78 
 
 		 265 aa  274  9e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  57.02 
 
 		 317 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  53.36 
 
 		 265 aa  273  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2417  ABC transporter related  58.33 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  55.88 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  55.42 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  58.37 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  56.25 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  56.2 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  55.04 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  55.56 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2714  ABC transporter related  58.33 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  56.56 
 
 		 316 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  56.43 
 
 		 243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  55.47 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.33 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  53.66 
 
 		 264 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  52.82 
 
 		 262 aa  271  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  57.38 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  55.92 
 
 		 258 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  55.88 
 
 		 263 aa  271  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  54.17 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  56.33 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  56.33 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  56.33 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  56.33 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  53.69 
 
 		 244 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.33 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>