More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10090 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  100 
 
 
197 aa  397  1e-110  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.93 
 
 
200 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.45 
 
 
200 aa  132  2e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
198 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  35.5 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.18 
 
 
233 aa  78.6  6e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  31.22 
 
 
220 aa  78.2  8e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.97 
 
 
268 aa  76.3  3e-13  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  32.84 
 
 
203 aa  75.9  3e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1502  Methyltransferase type 12  36.97 
 
 
223 aa  70.5  1e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
211 aa  70.5  1e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 
155 aa  67.4  1e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
235 aa  65.1  6e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  29.92 
 
 
219 aa  65.1  6e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
239 aa  65.1  7e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
218 aa  63.9  1e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
225 aa  63.2  2e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  37.37 
 
 
232 aa  63.5  2e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
209 aa  63.9  2e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
281 aa  62.8  3e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
253 aa  63.2  3e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.57 
 
 
258 aa  62.8  3e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
225 aa  62.4  4e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
208 aa  62.4  4e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
201 aa  61.6  7e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.20373e-07  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 
265 aa  61.6  7e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  37.61 
 
 
251 aa  61.6  8e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.10618e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
255 aa  61.2  9e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  40.74 
 
 
336 aa  60.8  1e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
252 aa  60.8  1e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  25.42 
 
 
220 aa  60.5  2e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  31.3 
 
 
229 aa  60.1  2e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
252 aa  60.1  2e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  36.75 
 
 
251 aa  60.5  2e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.03036e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  37.61 
 
 
251 aa  60.5  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  37.61 
 
 
251 aa  60.5  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  36.75 
 
 
251 aa  60.1  2e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.19753e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  36.75 
 
 
251 aa  60.1  2e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.58566e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  25.42 
 
 
220 aa  60.5  2e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  25.42 
 
 
220 aa  60.5  2e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  25.42 
 
 
220 aa  60.5  2e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  25.42 
 
 
220 aa  60.5  2e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  25.42 
 
 
220 aa  60.5  2e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  37.61 
 
 
251 aa  60.1  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
275 aa  59.7  2e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  25.42 
 
 
220 aa  60.5  2e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
215 aa  59.3  3e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  30.08 
 
 
269 aa  59.3  3e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  36.75 
 
 
251 aa  59.3  4e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.34794e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  36.75 
 
 
251 aa  59.3  4e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.40427e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  36.75 
 
 
251 aa  59.3  4e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.76262e-06  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
240 aa  59.3  4e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  36.75 
 
 
251 aa  59.3  4e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.07707e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  36.79 
 
 
259 aa  59.3  4e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  29.79 
 
 
267 aa  58.9  4e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.86 
 
 
229 aa  59.3  4e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  36.75 
 
 
251 aa  59.3  4e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  8.73779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
246 aa  58.9  5e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
275 aa  58.9  5e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
194 aa  58.9  5e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  39 
 
 
238 aa  58.9  5e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.63 
 
 
238 aa  58.5  6e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  6.08227e-06  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 
240 aa  58.5  6e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.63 
 
 
235 aa  58.5  6e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  3.18811e-06 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 
218 aa  58.5  6e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  35.04 
 
 
283 aa  58.5  6e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  30.16 
 
 
242 aa  58.5  6e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
252 aa  58.2  7e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 
237 aa  58.5  7e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 
237 aa  58.5  7e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
261 aa  58.2  8e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.89 
 
 
230 aa  57.8  9e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
240 aa  57.8  1e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.33 
 
 
402 aa  57.8  1e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  7.41696e-11 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 
238 aa  57.4  1e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  31.93 
 
 
214 aa  57.4  1e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.77 
 
 
235 aa  57.4  1e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  36.75 
 
 
251 aa  57.4  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.89171e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
249 aa  57  2e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
251 aa  57  2e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.95 
 
 
235 aa  56.6  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 
252 aa  57  2e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  29.23 
 
 
216 aa  56.6  2e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  40.62 
 
 
258 aa  56.6  2e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  24.36 
 
 
250 aa  56.6  2e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  36.75 
 
 
251 aa  57  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.91 
 
 
206 aa  57  2e-07  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.65 
 
 
247 aa  55.8  3e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  38.46 
 
 
267 aa  56.2  3e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
228 aa  56.2  3e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.92 
 
 
252 aa  56.6  3e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 
240 aa  55.8  3e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
402 aa  55.8  4e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.69 
 
 
241 aa  55.5  5e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  34.19 
 
 
253 aa  55.5  5e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.3017e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 
232 aa  55.5  5e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
179 aa  55.5  5e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.13 
 
 
205 aa  55.5  5e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
228 aa  55.5  5e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  30.16 
 
 
201 aa  55.5  5e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>