175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1502 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1502  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 223 aa  450  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  55.77 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.66 
 
 		 268 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  45.95 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  38.79 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1197  Methyltransferase type 12  35.85 
 
 		 289 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.19 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.73 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  36.5 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  37.91 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  35.27 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  34.62 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  28.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  28.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  28.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  28.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  28.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  28.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  28.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.27 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 310 aa  52  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0301  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0499  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  27.21 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.32 
 
 		 374 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  39.42 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.36 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 334 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 253 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  37.27 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  35.58 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  38.38 
 
 		 410 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0062  methyltransferase  23.13 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.48034  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  31.43 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  36.71 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.72 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 457 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  34.45 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.67 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.82 
 
 		 373 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3415  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3515  methyltransferase type 11  41.05 
 
 		 372 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1783  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 300 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  31.43 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.45 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.45 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.43 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.93 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  34.91 
 
 		 288 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.27 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  36.36 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.82 
 
 		 362 aa  45.1  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 252 aa  45.1  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02547  polyketide synthase, putative (Eurofung)  28.86 
 
 		 2534 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  26.03 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.41 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.62 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.31 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 333 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  30.77 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  32.73 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.33 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.36 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  35.9 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.36 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.7 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  33.67 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  29.77 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  36.45 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.7 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.17 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.01 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 327 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.69 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.24 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.52 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.72 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 996 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>