More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2188 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  100 
 
 		 467 aa  926    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  39.31 
 
 		 498 aa  339  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  38.72 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  38.72 
 
 		 492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  42.31 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  40.43 
 
 		 485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  40.75 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  38.7 
 
 		 471 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  42.82 
 
 		 506 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2439  isochorismate synthase  36.49 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  37.47 
 
 		 445 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  39.9 
 
 		 451 aa  216  9e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  35.18 
 
 		 475 aa  211  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.96 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01951  isochorismate synthase  33.62 
 
 		 465 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.109371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  31.26 
 
 		 466 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  31.48 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  33.26 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  32.66 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.49 
 
 		 476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.04 
 
 		 476 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  43.77 
 
 		 482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.92 
 
 		 464 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.92 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.92 
 
 		 464 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.92 
 
 		 464 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  34.33 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.9 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.92 
 
 		 464 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.92 
 
 		 464 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.7 
 
 		 464 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  35.12 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  46.32 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  44.14 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.7 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  36.57 
 
 		 554 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  52.74 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  52.74 
 
 		 476 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  52.74 
 
 		 476 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  43.08 
 
 		 469 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  31.47 
 
 		 464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  36.07 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  33.48 
 
 		 455 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  34.81 
 
 		 451 aa  176  9e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  35.65 
 
 		 495 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  34.66 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  51.01 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  51.01 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  51.01 
 
 		 492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  38.63 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  50 
 
 		 481 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  35.05 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  34.73 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  34.07 
 
 		 483 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  34.22 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  37.26 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  38.7 
 
 		 391 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  38.17 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  38.17 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  38.17 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  38.17 
 
 		 391 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  38.31 
 
 		 391 aa  160  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  38.31 
 
 		 391 aa  160  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  38.31 
 
 		 391 aa  160  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  38.31 
 
 		 391 aa  160  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  38.31 
 
 		 391 aa  160  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  33.64 
 
 		 482 aa  159  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  38.31 
 
 		 391 aa  160  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  39.11 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  39.11 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  37.93 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02061  isochorismate synthase  25.38 
 
 		 465 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  37.67 
 
 		 418 aa  156  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  37.5 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  40.82 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  37.5 
 
 		 391 aa  154  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  29.93 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  36.6 
 
 		 398 aa  154  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0179  isochorismate synthase  24.67 
 
 		 470 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  37.69 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  34.22 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  37.15 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  36.98 
 
 		 398 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  34.07 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  31.11 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.04 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  32.04 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  32.04 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  35.42 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  32.04 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.04 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  39.85 
 
 		 424 aa  148  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01971  isochorismate synthase  25.11 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  33.46 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  37.1 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  35.61 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  35.21 
 
 		 386 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.04 
 
 		 431 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  34.32 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  39.76 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>