More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0194 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  59.32 
 
 		 966 aa  1137    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  52.58 
 
 		 986 aa  967    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  59.79 
 
 		 977 aa  1146    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0693  DNA polymerase I  56.01 
 
 		 998 aa  1005    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.433628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  56.87 
 
 		 986 aa  1008    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  50.15 
 
 		 976 aa  925    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  100 
 
 		 953 aa  1927    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  53.77 
 
 		 985 aa  974    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  56.17 
 
 		 986 aa  974    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  50.05 
 
 		 976 aa  917    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  49.85 
 
 		 976 aa  907    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  49.9 
 
 		 1045 aa  995    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  61.68 
 
 		 982 aa  1162    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  57.54 
 
 		 982 aa  1103    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  59.42 
 
 		 972 aa  1130    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  59.42 
 
 		 972 aa  1130    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  50.15 
 
 		 976 aa  919    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  52.43 
 
 		 986 aa  970    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  41.14 
 
 		 891 aa  633  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 928 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 928 aa  628  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 928 aa  628  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 928 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  41.34 
 
 		 936 aa  629  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 928 aa  628  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 928 aa  628  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  40.39 
 
 		 928 aa  628  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 928 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 928 aa  628  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 950 aa  622  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 932 aa  622  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 892 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  37.8 
 
 		 956 aa  622  1e-176  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 932 aa  622  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 932 aa  622  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 928 aa  619  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  40.54 
 
 		 944 aa  616  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  40.1 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 892 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  41.02 
 
 		 945 aa  609  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 931 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 951 aa  608  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  39.49 
 
 		 934 aa  606  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  40.18 
 
 		 939 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  39.03 
 
 		 941 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 928 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 943 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  39.28 
 
 		 929 aa  600  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 949 aa  602  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  39.59 
 
 		 929 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  38.45 
 
 		 930 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  39.71 
 
 		 888 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.1 
 
 		 928 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 924 aa  595  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 946 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 965 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.29 
 
 		 930 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.07 
 
 		 903 aa  591  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.99 
 
 		 926 aa  589  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 934 aa  592  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 911 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  39.71 
 
 		 891 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.11 
 
 		 903 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  38.59 
 
 		 892 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  39.96 
 
 		 924 aa  587  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  41.99 
 
 		 908 aa  588  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  38.59 
 
 		 892 aa  588  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  40.25 
 
 		 893 aa  585  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  38.09 
 
 		 934 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  38.08 
 
 		 928 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 932 aa  584  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  38.85 
 
 		 908 aa  585  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  39.04 
 
 		 896 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 935 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  38.21 
 
 		 939 aa  581  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  40.84 
 
 		 915 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  37.1 
 
 		 902 aa  582  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  40.93 
 
 		 902 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 915 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 906 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  38.94 
 
 		 896 aa  577  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  40.37 
 
 		 915 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 934 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 915 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 899 aa  579  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 899 aa  579  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 988 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  38.21 
 
 		 928 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  36.99 
 
 		 902 aa  578  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  38.22 
 
 		 945 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  38.23 
 
 		 923 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  38.43 
 
 		 943 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  38.21 
 
 		 953 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  37.68 
 
 		 956 aa  575  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 942 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 892 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  38.27 
 
 		 915 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>