More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1255 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  699    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  72.76 
 
 		 343 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  71.16 
 
 		 347 aa  484  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  69.78 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  74.06 
 
 		 346 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  71.25 
 
 		 341 aa  478  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  70.72 
 
 		 364 aa  478  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  70.52 
 
 		 346 aa  480  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  70.43 
 
 		 348 aa  475  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  68.21 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  69.69 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  69.94 
 
 		 341 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  66.67 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  66.67 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  66.05 
 
 		 352 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  66.05 
 
 		 352 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1920  recA protein  71.88 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000130185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  70.94 
 
 		 349 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  69.28 
 
 		 336 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  66.04 
 
 		 365 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  66.46 
 
 		 362 aa  463  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  69.09 
 
 		 361 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  66.87 
 
 		 358 aa  463  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  66.77 
 
 		 350 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  71.34 
 
 		 345 aa  461  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  66.35 
 
 		 359 aa  458  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  65.72 
 
 		 376 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  67.3 
 
 		 347 aa  458  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  67.3 
 
 		 345 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  65.73 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  66.25 
 
 		 345 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  67.3 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  64.15 
 
 		 366 aa  454  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  67.19 
 
 		 349 aa  456  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  66.77 
 
 		 347 aa  454  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  67.62 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  65.74 
 
 		 345 aa  454  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  66.06 
 
 		 338 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  66.35 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  65.43 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  66.25 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  65.62 
 
 		 350 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  66.14 
 
 		 360 aa  455  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  67.31 
 
 		 344 aa  454  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  64.91 
 
 		 367 aa  456  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  63.35 
 
 		 364 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  65.74 
 
 		 345 aa  454  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  66.06 
 
 		 338 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  66.56 
 
 		 358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  66.36 
 
 		 358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  65.62 
 
 		 362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  60.88 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  65.2 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  67.3 
 
 		 350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  66.36 
 
 		 358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  64.06 
 
 		 346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  63.75 
 
 		 350 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  64.06 
 
 		 368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  60.67 
 
 		 379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  66.04 
 
 		 350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  62.26 
 
 		 346 aa  447  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  68.08 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  65 
 
 		 352 aa  448  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  69.57 
 
 		 356 aa  450  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  61.76 
 
 		 342 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  66.05 
 
 		 358 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  65.41 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  64.24 
 
 		 351 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  61.23 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  65.31 
 
 		 362 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  64.92 
 
 		 359 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  62.92 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  63.75 
 
 		 351 aa  447  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  66.35 
 
 		 350 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  64.91 
 
 		 357 aa  447  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  65.09 
 
 		 378 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  64.17 
 
 		 363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  65.11 
 
 		 343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  62.61 
 
 		 361 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  64.06 
 
 		 343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  65.72 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  62.61 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  63.75 
 
 		 366 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  67.56 
 
 		 343 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  64.69 
 
 		 363 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  64.06 
 
 		 363 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  63.44 
 
 		 363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  64.69 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  65.72 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  63.64 
 
 		 355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  64.69 
 
 		 362 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  64.47 
 
 		 352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  62.27 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  63.75 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  64.38 
 
 		 383 aa  444  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  65.72 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  71.61 
 
 		 343 aa  441  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  63.86 
 
 		 362 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  71.94 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  69.69 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>