More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0544 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  56.2 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  48.99 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 147 aa  157  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 159 aa  155  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.41 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.52 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.62 
 
 		 184 aa  154  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 		 146 aa  153  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 147 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.59 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  53.42 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.62 
 
 		 142 aa  150  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.7 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.59 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  55.22 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  52.21 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.44 
 
 		 165 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  51.97 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.94 
 
 		 152 aa  143  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.41 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  48.67 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.52 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.94 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  41.61 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2570  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 147 aa  140  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.18 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  47.33 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.85 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  48.09 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>