78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3293 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  317  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  36.84 
 
 		 166 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  36.57 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  33.12 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  37.5 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  33.59 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  35.9 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0375  putative bile acid 7-alpha dehydratase  30.97 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  35.97 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  36.92 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  37.1 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  32.45 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  34.68 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  37.1 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  34.11 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  37.1 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  34.27 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  29.63 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  35 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  33.6 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  29.05 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  25.93 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  35.2 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  29.32 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  33.09 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  33.83 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  33.09 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  33.09 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  32.62 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  30.58 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  34.07 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  31.39 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  34.43 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  32.31 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  29.92 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  30.53 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  34.45 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  31.75 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  25.74 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  30.72 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  31.29 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  34.59 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  29.56 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  28.15 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  31.39 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  26.87 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  31.39 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  31.11 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  28.91 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  31.65 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  35.43 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  28.26 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  30.4 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  26.62 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  26.98 
 
 		 208 aa  44.3  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  28.8 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  29.17 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5085  hypothetical protein  30.57 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.6936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  30.25 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  26.81 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  28.8 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  28.12 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2101  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  28.12 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  30.95 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  27.74 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  28.69 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  26.76 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2163  hypothetical protein  31.82 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  30.5 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>