More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2402 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  627  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  69.58 
 
 		 324 aa  358  9e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  57.47 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  51.45 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  49.52 
 
 		 342 aa  268  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  48.43 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  48.87 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 339 aa  265  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  46.28 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  50.65 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  48.39 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 317 aa  235  9e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  41.12 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  38 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  36.52 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  33.44 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  35.17 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  34.8 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 348 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  30.42 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 326 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  30.48 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  32.52 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  31.51 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  32.01 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 331 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.43 
 
 		 420 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  28.53 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.14 
 
 		 207 aa  85.9  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.14 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  32.07 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  32.24 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.97 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 117 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.49 
 
 		 259 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 200 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 200 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 319 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 257 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 119 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  37.04 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 117 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2360  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175254  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 		 95 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2739  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  35.25 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.04 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.2 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  37.07 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>