More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1698 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
298 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
286 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
291 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
291 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
291 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
291 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
281 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 
291 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
280 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
284 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 
286 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
276 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
271 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
282 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
290 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
290 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
290 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 
287 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
285 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
279 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
280 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
294 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.15 
 
 
279 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  42.7 
 
 
280 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
273 aa  140  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  39.73 
 
 
284 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  40.17 
 
 
276 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  37.59 
 
 
284 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  44.86 
 
 
303 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
279 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
300 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  37.66 
 
 
286 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 
276 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
283 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  37.19 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
271 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
269 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
268 aa  135  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.44 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02393  short chain oxidoreductase/dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01770)  37.11 
 
 
287 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.559669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 
286 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
278 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
286 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 
278 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 
287 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  37.59 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  40.27 
 
 
278 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
286 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  39.09 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  39.09 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0773345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  39.09 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.16 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
272 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
284 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 
277 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
285 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.593467  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
276 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
290 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
282 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
272 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  37.85 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>