More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0094 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
498 aa  1025  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  54.75 
 
 
501 aa  546  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  38.18 
 
 
538 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  39.27 
 
 
546 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  7.75897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  36.84 
 
 
533 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  38.54 
 
 
539 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.25789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 
540 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.96 
 
 
538 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  36.57 
 
 
540 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  37.17 
 
 
534 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  35.66 
 
 
576 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 
565 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  32.92 
 
 
563 aa  305  1e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 
551 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
559 aa  250  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.87 
 
 
532 aa  214  3e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.84044e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1565  oligopeptide-binding protein, putative  38.44 
 
 
381 aa  210  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.306093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
508 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 
553 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.01 
 
 
511 aa  198  2e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  4.30411e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
526 aa  197  5e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.32 
 
 
511 aa  193  6e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 
619 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
555 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  28.33 
 
 
510 aa  185  2e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 
557 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.65 
 
 
511 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 
509 aa  180  5e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 
622 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 
502 aa  175  2e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.02 
 
 
505 aa  175  2e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.75 
 
 
528 aa  174  4e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.75 
 
 
528 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.07652e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.75 
 
 
528 aa  172  8e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.76887e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.54 
 
 
528 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  8.13115e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.54 
 
 
528 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.78589e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.81 
 
 
520 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
528 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.54 
 
 
528 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.75 
 
 
529 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
618 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.63 
 
 
511 aa  170  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.54 
 
 
529 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.31 
 
 
511 aa  170  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
529 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.65149e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
528 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  3.82125e-05  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.95 
 
 
509 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 
505 aa  167  3e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.69 
 
 
579 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.69 
 
 
580 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  28.04 
 
 
520 aa  165  2e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
510 aa  165  2e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 
495 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.32 
 
 
510 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  25.15 
 
 
531 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.16 
 
 
592 aa  160  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.76 
 
 
532 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
532 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.76 
 
 
532 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 
538 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
511 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.81 
 
 
521 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.51 
 
 
565 aa  157  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
591 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.61 
 
 
521 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.61 
 
 
521 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.61 
 
 
521 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 
521 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 
512 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
510 aa  154  3e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 
506 aa  154  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
519 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
542 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 
534 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2475  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
521 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0955412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.44 
 
 
535 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 
600 aa  153  6e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.52 
 
 
545 aa  153  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
515 aa  152  9e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 
580 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.07469e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.47 
 
 
593 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.47 
 
 
593 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.47 
 
 
593 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.23 
 
 
508 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.51 
 
 
593 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
508 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 
573 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.57 
 
 
593 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 
589 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.61 
 
 
593 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
608 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
520 aa  149  1e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 
501 aa  149  1e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  25.85 
 
 
520 aa  149  1e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
500 aa  149  1e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
520 aa  149  1e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
527 aa  149  1e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 
537 aa  149  1e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
522 aa  149  2e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 
544 aa  149  2e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>