253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0030 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  100 
 
 
221 aa  447  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2289  flagellar hook capping protein  51.03 
 
 
229 aa  199  2e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  46.15 
 
 
235 aa  189  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0009  flagellar basal body rod modification protein  42.52 
 
 
263 aa  169  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  39.49 
 
 
235 aa  154  7e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  38.35 
 
 
287 aa  131  8e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  38.05 
 
 
294 aa  130  2e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  38.05 
 
 
294 aa  130  2e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  32 
 
 
225 aa  121  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  31.8 
 
 
225 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  31.8 
 
 
225 aa  117  1e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  31.76 
 
 
234 aa  117  2e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  34.12 
 
 
235 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  31.96 
 
 
225 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  31.34 
 
 
218 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  32.7 
 
 
221 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  32.7 
 
 
221 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  30.81 
 
 
229 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  31.96 
 
 
224 aa  102  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  32.14 
 
 
221 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  31.53 
 
 
263 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  31.71 
 
 
220 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  32.56 
 
 
242 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  32.94 
 
 
222 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  31.44 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  32.29 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  32.29 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  30.3 
 
 
218 aa  98.6  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  30.85 
 
 
220 aa  98.6  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  27.27 
 
 
226 aa  98.2  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  32.02 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  33.5 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  29.08 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  32.12 
 
 
251 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  30.92 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  29.02 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  27.43 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  31.64 
 
 
278 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  30.43 
 
 
226 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1519  flagellar hook assembly protein FlgD  41.67 
 
 
335 aa  92.4  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  29.11 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  32.89 
 
 
248 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  30.54 
 
 
221 aa  91.7  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  27.88 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 
277 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 
248 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 
280 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 
277 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 
280 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 
277 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  29.26 
 
 
284 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 
277 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  31.58 
 
 
280 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  30.88 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  27.32 
 
 
222 aa  89  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  28.65 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 
247 aa  88.2  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  30 
 
 
221 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  28.86 
 
 
225 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  28.86 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  27.47 
 
 
265 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  27.31 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  30.63 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  33.86 
 
 
228 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  27.8 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  28.74 
 
 
293 aa  85.5  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  31.28 
 
 
220 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 
233 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  31.25 
 
 
223 aa  84.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 
221 aa  84.3  1e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  30.58 
 
 
263 aa  84  1e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  31.47 
 
 
256 aa  83.2  3e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  26.54 
 
 
230 aa  82.8  4e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  29.26 
 
 
224 aa  82.4  5e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  29.53 
 
 
231 aa  82  6e-15  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  29.53 
 
 
231 aa  82  6e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  29.44 
 
 
229 aa  81.6  9e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  29.02 
 
 
231 aa  81.3  1e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  29.02 
 
 
231 aa  80.9  1e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  29.02 
 
 
231 aa  81.3  1e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  29.02 
 
 
231 aa  81.3  1e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  29.02 
 
 
231 aa  81.3  1e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  27.08 
 
 
221 aa  81.3  1e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  28.5 
 
 
231 aa  80.5  2e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  30.81 
 
 
228 aa  80.5  2e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  32.7 
 
 
226 aa  80.1  3e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  26.89 
 
 
227 aa  79.3  4e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  30.41 
 
 
231 aa  79.3  5e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  30.34 
 
 
240 aa  78.6  7e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  30.07 
 
 
236 aa  78.2  9e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  27.46 
 
 
222 aa  78.2  9e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  26.53 
 
 
222 aa  77.8  1e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  23.83 
 
 
222 aa  77  2e-13  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  30.34 
 
 
240 aa  77.4  2e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  27.47 
 
 
232 aa  76.6  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  27.47 
 
 
232 aa  76.6  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  27.47 
 
 
232 aa  76.6  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>