More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0008 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0008  histidine kinase  100 
 
 
630 aa  1264  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0750  histidine kinase  25.66 
 
 
616 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.806189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  29.69 
 
 
532 aa  108  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.48075e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
592 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
409 aa  102  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
751 aa  98.2  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  26.25 
 
 
542 aa  95.1  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
452 aa  93.6  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  26.8 
 
 
394 aa  92  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
751 aa  91.3  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 
473 aa  90.9  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
475 aa  90.9  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  26.99 
 
 
856 aa  89.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
780 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
839 aa  88.6  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
1341 aa  88.2  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
741 aa  87.4  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 
933 aa  86.3  1e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  3.19453e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 
773 aa  86.7  1e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
660 aa  85.5  3e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
441 aa  84.3  5e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
756 aa  84.3  6e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
360 aa  84.3  6e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  25.32 
 
 
411 aa  84  8e-15  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  28.57 
 
 
552 aa  83.6  9e-15  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.15 
 
 
1171 aa  82.8  2e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.19 
 
 
1171 aa  82  3e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35263e-07 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
441 aa  82  3e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
1255 aa  81.6  3e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
592 aa  82  3e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
441 aa  82  3e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
452 aa  80.5  8e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.57 
 
 
1306 aa  79.3  2e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  22.75 
 
 
540 aa  79  3e-13  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
514 aa  78.6  4e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
452 aa  78.2  5e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 
412 aa  77.8  6e-13  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  24.88 
 
 
689 aa  77.8  6e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
701 aa  77  1e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  5.62313e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  21 
 
 
708 aa  77  1e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
399 aa  76.3  2e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
441 aa  75.9  2e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  23.11 
 
 
553 aa  75.9  2e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
487 aa  75.5  3e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  23.77 
 
 
465 aa  75.5  3e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  9.02576e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  21.92 
 
 
715 aa  74.7  4e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  24.78 
 
 
529 aa  75.1  4e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  28.04 
 
 
740 aa  75.1  4e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1665  sensory box sensor histidine kinase, putative  29.34 
 
 
403 aa  74.7  5e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  25.61 
 
 
687 aa  74.7  5e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  27.19 
 
 
516 aa  74.3  6e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  21.89 
 
 
1710 aa  74.3  6e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1484  sensory box sensor histidine kinase, putative  28.96 
 
 
403 aa  74.3  6e-12  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  28.44 
 
 
246 aa  73.9  8e-12  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
619 aa  73.6  1e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 
416 aa  72.4  2e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.71 
 
 
930 aa  72.8  2e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  23.39 
 
 
813 aa  72  3e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  24.36 
 
 
394 aa  72  3e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
619 aa  72  3e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  25.97 
 
 
407 aa  71.6  4e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2360  histidine kinase  24.58 
 
 
367 aa  71.2  5e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  21.72 
 
 
645 aa  70.9  6e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
554 aa  70.9  8e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  22.12 
 
 
600 aa  70.9  8e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0982  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
377 aa  70.9  8e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0849  putative two component sensor kinase  28.11 
 
 
667 aa  70.1  1e-10  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4005  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
545 aa  69.3  2e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.06341e-05 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  24.1 
 
 
696 aa  68.9  2e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
469 aa  69.7  2e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3849  ATP-binding region ATPase domain protein  25.7 
 
 
483 aa  69.3  2e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
755 aa  68.9  3e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
720 aa  68.9  3e-10  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
403 aa  68.2  4e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3249  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
546 aa  67.8  5e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.632077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
675 aa  68.2  5e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 
712 aa  68.2  5e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  24.89 
 
 
623 aa  67.8  6e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 
503 aa  67.4  7e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  25 
 
 
572 aa  66.6  1e-09  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 
556 aa  67  1e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 
408 aa  67  1e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  23.89 
 
 
597 aa  67  1e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 
929 aa  66.6  1e-09  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 
371 aa  65.9  2e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 
404 aa  65.9  2e-09  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
991 aa  65.9  2e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  9.69954e-06 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6828  histidine kinase  28.07 
 
 
465 aa  65.9  2e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  27 
 
 
601 aa  65.5  3e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
991 aa  65.5  3e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  7.34254e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  22.79 
 
 
602 aa  65.5  3e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 
780 aa  65.5  3e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 
537 aa  65.5  3e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
991 aa  65.5  3e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.40339e-08 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  22.13 
 
 
655 aa  65.5  3e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
652 aa  65.1  3e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  23.34 
 
 
453 aa  64.7  5e-09  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
666 aa  64.7  6e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4764  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.8 
 
 
560 aa  64.3  6e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  21.99 
 
 
651 aa  64.3  6e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>