More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0819 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1286 aa  2617    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  67.67 
 
 
1292 aa  1711    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  74.44 
 
 
1283 aa  1954    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  36.23 
 
 
1321 aa  672    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  67.21 
 
 
1035 aa  1344    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  30.75 
 
 
1109 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.13 
 
 
1099 aa  340  8e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  29.95 
 
 
1099 aa  340  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  33.18 
 
 
1300 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.1 
 
 
1293 aa  314  7.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  31.89 
 
 
1300 aa  313  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0731  hypothetical protein  64.98 
 
 
235 aa  302  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  32.05 
 
 
1298 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  31.78 
 
 
1298 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  32.09 
 
 
1298 aa  297  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  31.93 
 
 
1298 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  30.28 
 
 
1265 aa  291  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  30.89 
 
 
1258 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 
1474 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  26.9 
 
 
1116 aa  271  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  27.91 
 
 
1115 aa  267  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.89 
 
 
1160 aa  260  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 
1659 aa  248  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.04 
 
 
728 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  32.11 
 
 
971 aa  234  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.68 
 
 
1199 aa  232  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  28.22 
 
 
1042 aa  229  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.67 
 
 
1312 aa  228  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  30.33 
 
 
983 aa  227  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  27.04 
 
 
1287 aa  226  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.94 
 
 
1649 aa  221  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  29.37 
 
 
1725 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  29.81 
 
 
1312 aa  215  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  28.3 
 
 
1639 aa  209  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  27.72 
 
 
1634 aa  207  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.45 
 
 
1648 aa  207  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.72 
 
 
891 aa  204  9e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.91 
 
 
1648 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.91 
 
 
1648 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  28.3 
 
 
1406 aa  201  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.69 
 
 
1649 aa  201  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.34 
 
 
1645 aa  200  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  27.76 
 
 
1638 aa  199  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  27.47 
 
 
917 aa  194  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  28.07 
 
 
917 aa  193  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  30.32 
 
 
1407 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  30.32 
 
 
1407 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  26.9 
 
 
917 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  26.9 
 
 
917 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.6 
 
 
1638 aa  191  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  29.15 
 
 
994 aa  189  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  26.93 
 
 
917 aa  189  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  29.17 
 
 
1407 aa  188  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  27.05 
 
 
917 aa  188  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.34 
 
 
1638 aa  188  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  27.56 
 
 
917 aa  187  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  26.93 
 
 
917 aa  187  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  29.5 
 
 
1406 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  28.01 
 
 
1739 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  28.41 
 
 
1006 aa  187  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  27.49 
 
 
917 aa  185  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.9 
 
 
915 aa  179  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  27.12 
 
 
1683 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  25.64 
 
 
1705 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  25.64 
 
 
1705 aa  175  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.21 
 
 
1000 aa  174  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.44 
 
 
860 aa  172  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.11 
 
 
1323 aa  172  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.58 
 
 
1399 aa  164  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.29 
 
 
1705 aa  164  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  27.5 
 
 
1109 aa  162  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.07 
 
 
1124 aa  160  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.97 
 
 
1669 aa  160  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.09 
 
 
1212 aa  157  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.31 
 
 
1706 aa  155  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  26.75 
 
 
1570 aa  149  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.56 
 
 
1776 aa  147  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  26.64 
 
 
1570 aa  146  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.45 
 
 
1383 aa  145  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  25.42 
 
 
1045 aa  143  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.63 
 
 
883 aa  142  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.09 
 
 
860 aa  142  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.6 
 
 
1234 aa  141  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  26.42 
 
 
1220 aa  139  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  28.96 
 
 
1618 aa  135  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  25.93 
 
 
1215 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  27.22 
 
 
1809 aa  131  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  29.43 
 
 
1570 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 
660 aa  125  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.94 
 
 
1092 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  26.34 
 
 
1962 aa  110  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  27.74 
 
 
1221 aa  110  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.45 
 
 
1565 aa  109  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.48 
 
 
1075 aa  108  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.93 
 
 
1212 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.93 
 
 
1212 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.93 
 
 
1212 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  29.93 
 
 
962 aa  103  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.88 
 
 
1060 aa  101  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  24.65 
 
 
2042 aa  100  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>