More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4339 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  100 
 
 
305 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2612  ABC transporter related protein  67.1 
 
 
314 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.472941 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4939  ABC transporter related  55.37 
 
 
334 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0242124 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  41.01 
 
 
338 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  45.39 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  38.85 
 
 
360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
371 aa  211  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.58 
 
 
321 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 
309 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.05 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0292  ABC transporter related  32.48 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.274701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  36.39 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0699  ABC transporter related  38.69 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  39.17 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  42.49 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  40.84 
 
 
311 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  34.84 
 
 
316 aa  192  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0872  ABC transporter related  45.41 
 
 
229 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0610304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  37.99 
 
 
338 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3258  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
307 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335184  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.27 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0987  ABC transporter-like protein  37.06 
 
 
305 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.488285  normal  0.723293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  41.61 
 
 
314 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  37.46 
 
 
334 aa  185  9e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  36.84 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.49 
 
 
309 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.02 
 
 
305 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
251 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  35.9 
 
 
327 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  36.25 
 
 
334 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.6 
 
 
318 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  36.59 
 
 
303 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  38.19 
 
 
316 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.96 
 
 
411 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  37.05 
 
 
325 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
309 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  40.81 
 
 
259 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.18 
 
 
325 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  36.68 
 
 
319 aa  175  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.72 
 
 
312 aa  175  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  35.5 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.27 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.23 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  34.21 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  39.53 
 
 
241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.44 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40.51 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.2 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
356 aa  172  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  39.45 
 
 
252 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 
339 aa  172  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.31 
 
 
325 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  39.67 
 
 
340 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.17 
 
 
325 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.03 
 
 
348 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.51 
 
 
328 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.25 
 
 
331 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.74 
 
 
315 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  37.95 
 
 
305 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  33.22 
 
 
305 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  37.58 
 
 
320 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  33.01 
 
 
327 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  37.79 
 
 
243 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 
306 aa  169  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.72 
 
 
334 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
274 aa  169  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.07 
 
 
338 aa  169  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 
306 aa  168  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  34.87 
 
 
243 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.6 
 
 
316 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  38.89 
 
 
306 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1411  ABC-type transport system, ATPase component  34.36 
 
 
317 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715833  unclonable  3.14e-28 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  35.95 
 
 
305 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  37.26 
 
 
303 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  42.34 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1333  ABC transporter related  38.1 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.573564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 
305 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  36.18 
 
 
308 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 
305 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.52 
 
 
279 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 
305 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  36.74 
 
 
266 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.42 
 
 
338 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.85 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
305 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  32.89 
 
 
306 aa  165  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  33.12 
 
 
305 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  31.68 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  31.68 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.82 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.29 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.39 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  40.36 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>