More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2712 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.85 
 
 		 266 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.25 
 
 		 266 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.857449 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.62 
 
 		 266 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.47 
 
 		 266 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.14 
 
 		 266 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.14 
 
 		 266 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.26 
 
 		 266 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  72.18 
 
 		 266 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.45 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.16 
 
 		 240 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0813  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.82 
 
 		 253 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.67 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.81 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.92 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.95 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0637  short chain dehydrogenase  47.9 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00978147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003864  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  44.86 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.013707  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01815  short chain dehydrogenase  45.27 
 
 		 241 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  38.43 
 
 		 239 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0959  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4738  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 		 250 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1119  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  43.63 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2737  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.88 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.576341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.58 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 		 277 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2469  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 265 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 		 277 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  37.17 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0729  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 		 261 aa  122  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 		 261 aa  122  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0496  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0230  hypothetical protein  36.33 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.599536 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6102  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0605001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.461582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2676  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0379321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1087  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  31.3 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3765  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0427  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 		 253 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  29.76 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.85 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0185  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  32.22 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.836425  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1738  short chain dehydrogenase  32.99 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0147369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 		 247 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 250 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 		 245 aa  89.7  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  27.63 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>