More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2094 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
541 aa  1058  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  74.49 
 
 
572 aa  775  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  68.65 
 
 
572 aa  700  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  59.03 
 
 
575 aa  598  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  56.9 
 
 
562 aa  582  1e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  55.68 
 
 
566 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  55.97 
 
 
561 aa  551  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  54.44 
 
 
558 aa  528  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  52.14 
 
 
561 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  47.38 
 
 
595 aa  468  1e-130  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  48.6 
 
 
546 aa  465  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  47.65 
 
 
551 aa  460  1e-128  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  60.24 
 
 
424 aa  455  1e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  45.32 
 
 
548 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  47.7 
 
 
547 aa  417  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  47.51 
 
 
547 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  45.14 
 
 
720 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  45.3 
 
 
566 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  40.69 
 
 
566 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  42.7 
 
 
565 aa  364  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  41.2 
 
 
566 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  1.10445e-08 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  40.08 
 
 
566 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  33.19 
 
 
577 aa  223  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  29.22 
 
 
574 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 
576 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 
592 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.08 
 
 
575 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  29.22 
 
 
578 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  28.84 
 
 
574 aa  202  2e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  33.54 
 
 
571 aa  202  2e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 
581 aa  191  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  29.09 
 
 
648 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  28.23 
 
 
648 aa  183  9e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  28.23 
 
 
648 aa  183  9e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.65 
 
 
648 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  26.13 
 
 
648 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  26.13 
 
 
648 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  26.13 
 
 
648 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 
775 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  32.69 
 
 
598 aa  173  6e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  28.84 
 
 
457 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 
636 aa  171  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  25.92 
 
 
648 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  27.62 
 
 
682 aa  170  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  26.86 
 
 
649 aa  169  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 
653 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  25.15 
 
 
649 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 
664 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.68 
 
 
648 aa  167  3e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  27.49 
 
 
650 aa  167  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 
584 aa  167  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 
673 aa  166  7e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 
674 aa  165  2e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
741 aa  164  5e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  25.38 
 
 
650 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  31.04 
 
 
624 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.65 
 
 
663 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  27.14 
 
 
662 aa  160  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 
567 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 
654 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  23.73 
 
 
649 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  26.98 
 
 
584 aa  158  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 
671 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 
762 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.76 
 
 
567 aa  154  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  25.57 
 
 
567 aa  154  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  25.05 
 
 
657 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.82 
 
 
671 aa  154  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 
656 aa  154  6e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  26 
 
 
771 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  25.98 
 
 
563 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  25.6 
 
 
649 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  26.45 
 
 
562 aa  152  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  1.31586e-05 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 
520 aa  152  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  23.99 
 
 
563 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  4.02209e-08 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  25.83 
 
 
598 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  26.31 
 
 
585 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  25.77 
 
 
563 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 
773 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.9 
 
 
720 aa  148  2e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  25.41 
 
 
561 aa  148  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 
668 aa  147  4e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 
658 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  25 
 
 
561 aa  146  8e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.97 
 
 
553 aa  146  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  25.05 
 
 
674 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 
659 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0944  potassium efflux system protein  27.36 
 
 
610 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.728384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 
528 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49336e-06 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
666 aa  144  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 
606 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  26.99 
 
 
529 aa  144  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  24.49 
 
 
658 aa  142  1e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.59 
 
 
524 aa  143  1e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 
667 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  25.14 
 
 
566 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  23.72 
 
 
562 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.74 
 
 
582 aa  140  4e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  25.62 
 
 
606 aa  140  4e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 
660 aa  140  4e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>