More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0366 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 449 aa  920    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.5 
 
 		 454 aa  818    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  86.41 
 
 		 449 aa  768    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.5 
 
 		 458 aa  816    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  87.28 
 
 		 458 aa  816    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  85.97 
 
 		 449 aa  806    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.5 
 
 		 458 aa  818    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  85.52 
 
 		 449 aa  804    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  85.52 
 
 		 449 aa  798    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.93 
 
 		 455 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.93 
 
 		 459 aa  626  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  66.67 
 
 		 458 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  66.59 
 
 		 466 aa  592  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.82 
 
 		 455 aa  591  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  59.15 
 
 		 453 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  59.53 
 
 		 471 aa  548  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 467 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  33.41 
 
 		 468 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  33.55 
 
 		 462 aa  239  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  33.26 
 
 		 464 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  33.04 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  32.39 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  38.07 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  38.44 
 
 		 456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  38.17 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  36.66 
 
 		 458 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  36.66 
 
 		 458 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  36.66 
 
 		 458 aa  210  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  32.15 
 
 		 453 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  36.29 
 
 		 457 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  36.29 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  36.29 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  36.29 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  36.29 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  32.82 
 
 		 472 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  36.29 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  36.29 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  36.29 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  36.29 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  36.29 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  36.29 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  38.17 
 
 		 456 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  36.29 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  37.43 
 
 		 456 aa  206  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  36.02 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  36.02 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  35.6 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 389 aa  203  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  31.89 
 
 		 465 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 459 aa  200  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  36.83 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 435 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  37.63 
 
 		 465 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  37.14 
 
 		 480 aa  180  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  29.14 
 
 		 449 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 445 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 469 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  28.93 
 
 		 449 aa  176  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  30.32 
 
 		 456 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.33 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  35.96 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 416 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 421 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  35.89 
 
 		 471 aa  166  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 429 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  29.65 
 
 		 429 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  35.11 
 
 		 468 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  27 
 
 		 446 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 419 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 458 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  32.84 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  32.84 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 446 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 450 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  32.34 
 
 		 365 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 443 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.957037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>