124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0565 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  70.1 
 
 		 329 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  69.77 
 
 		 329 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  69.77 
 
 		 329 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  68.31 
 
 		 324 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  68.44 
 
 		 324 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  68.31 
 
 		 324 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.69 
 
 		 324 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  68.81 
 
 		 349 aa  434  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  67.3 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  65.83 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  68.3 
 
 		 320 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  61.39 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  50.32 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  35.84 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  31.17 
 
 		 312 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  34.59 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  34.84 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  31.34 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  31.93 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  29.62 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  28.71 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  28.71 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  28.71 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  29.87 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  29.87 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  31.53 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  29.68 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  27.76 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  28.25 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  28.67 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  30.59 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  30.08 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  30.08 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  30.08 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  30.08 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  30.2 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  30.2 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  30.2 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  30.2 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  30.2 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  30.2 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  30.2 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.13 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.32 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.05 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.9 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  26.26 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  24.03 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  24.01 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3312  RarD protein  29.22 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  25 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.81 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  27 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  31.82 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  24.42 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  24.12 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.41 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  26.88 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  21.71 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.57 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3198  hypothetical protein  29.22 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3132  RarD protein  29.22 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3149  RarD protein  29.22 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  22.95 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  23.25 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  23.25 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  23.72 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  23.25 
 
 		 299 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.42 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  23.79 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  23.26 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  23.3 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  24.59 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  23.26 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.3 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  25.32 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  25.32 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  22.92 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  24.48 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  22.69 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  23.42 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  26.13 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  23.3 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  25.32 
 
 		 512 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  23.42 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1262  hypothetical protein  21.56 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.44 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  26.58 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  23.42 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  22.27 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  22.97 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  23.27 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.86 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>