216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5218 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  100 
 
 
393 aa  773  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  63 
 
 
428 aa  471  1e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  47.81 
 
 
417 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  44.75 
 
 
419 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  47.11 
 
 
419 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  44.75 
 
 
407 aa  289  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  46.35 
 
 
436 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  45.28 
 
 
413 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  45.28 
 
 
413 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  47.54 
 
 
418 aa  283  3e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  44.19 
 
 
405 aa  283  4e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  43.38 
 
 
412 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  44.84 
 
 
413 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  42.39 
 
 
406 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  44.44 
 
 
420 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  43.64 
 
 
425 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  45.43 
 
 
415 aa  276  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  42.04 
 
 
403 aa  274  2e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  47.01 
 
 
461 aa  272  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  43.08 
 
 
416 aa  272  8e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  43.14 
 
 
414 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  42.11 
 
 
408 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  44.11 
 
 
411 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  42.04 
 
 
413 aa  262  9e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  45.23 
 
 
405 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  41.49 
 
 
411 aa  259  5e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  43.45 
 
 
425 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  41.62 
 
 
391 aa  254  2e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  40.71 
 
 
413 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  40.96 
 
 
445 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  41.74 
 
 
409 aa  230  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  41.43 
 
 
443 aa  229  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  36.14 
 
 
412 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  36.43 
 
 
412 aa  229  9e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  37.25 
 
 
411 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  37.4 
 
 
411 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  35.66 
 
 
440 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  36.45 
 
 
486 aa  201  2e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  37.14 
 
 
461 aa  198  1e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  36.93 
 
 
433 aa  197  2e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  35.7 
 
 
456 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  36.66 
 
 
426 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  33.82 
 
 
445 aa  189  6e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  34.62 
 
 
482 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  34.46 
 
 
447 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  37.13 
 
 
434 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  32.94 
 
 
420 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  32.77 
 
 
429 aa  186  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  35.32 
 
 
478 aa  185  1e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  33.33 
 
 
407 aa  184  2e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  33.75 
 
 
436 aa  184  2e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  32.3 
 
 
419 aa  179  5e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  34.54 
 
 
426 aa  179  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  32.61 
 
 
490 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  32.37 
 
 
447 aa  174  3e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  35.24 
 
 
447 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  33.58 
 
 
444 aa  167  3e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  32.89 
 
 
431 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.65 
 
 
407 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.07 
 
 
426 aa  164  2e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  32.35 
 
 
444 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  30.64 
 
 
451 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  32.09 
 
 
445 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  32.43 
 
 
430 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  35.47 
 
 
438 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.81 
 
 
400 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  33.53 
 
 
441 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  32.87 
 
 
423 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  33.16 
 
 
408 aa  156  5e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  33.16 
 
 
408 aa  156  5e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  33.16 
 
 
408 aa  156  5e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  31.73 
 
 
426 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  30.92 
 
 
407 aa  154  3e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  33.07 
 
 
405 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.97 
 
 
430 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  32.53 
 
 
470 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.57 
 
 
413 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.71 
 
 
412 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  30.33 
 
 
421 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  29.69 
 
 
459 aa  149  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  33.42 
 
 
432 aa  149  1e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  33.33 
 
 
411 aa  149  1e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  34.44 
 
 
459 aa  148  2e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  35.77 
 
 
432 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  31.37 
 
 
428 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  32.98 
 
 
440 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  32.07 
 
 
431 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  31.89 
 
 
422 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  32.35 
 
 
433 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  36.72 
 
 
422 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  31.99 
 
 
396 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  32.36 
 
 
390 aa  143  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  33.76 
 
 
402 aa  143  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  32.08 
 
 
455 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  32.37 
 
 
426 aa  142  1e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  32.42 
 
 
433 aa  142  1e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  29.62 
 
 
401 aa  141  2e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  33 
 
 
403 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  31.36 
 
 
409 aa  139  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  33 
 
 
391 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>