More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2095 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 256 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.44 
 
 		 236 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  52.86 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.77 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  52.89 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  50.87 
 
 		 235 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.07 
 
 		 240 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  52.65 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.89 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.77 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  46.28 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.26 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  45.85 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  48.05 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.1 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.96 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.35 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.15 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  43.88 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.46 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  44.16 
 
 		 241 aa  198  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  45.19 
 
 		 257 aa  198  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.96 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  43.46 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  47.56 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  46.19 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  47.09 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  45.37 
 
 		 251 aa  190  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.51 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 233 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  43.37 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  45.74 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 225 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  42.15 
 
 		 223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  45.41 
 
 		 232 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  43.35 
 
 		 237 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 224 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>