More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0044 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0044  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 
296 aa  587  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  48.75 
 
 
286 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  39.18 
 
 
289 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0840  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.27 
 
 
311 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  41.15 
 
 
291 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  34.4 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  35.82 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  36.13 
 
 
546 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  35.9 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0524  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.97 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0604  gluconolactonase  41.18 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0638316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.31 
 
 
318 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.37 
 
 
569 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1013  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  41.78 
 
 
278 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.85 
 
 
281 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.54 
 
 
287 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.52 
 
 
302 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.22 
 
 
292 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0568  regucalcin family protein  33.55 
 
 
291 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  40.11 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  37.1 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.75 
 
 
302 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.1 
 
 
302 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.94 
 
 
289 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.67 
 
 
293 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.56 
 
 
330 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.15283  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  35.71 
 
 
293 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  36.36 
 
 
294 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0358  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  41.09 
 
 
305 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.0997512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.94 
 
 
296 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.08 
 
 
295 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  38.72 
 
 
294 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  34.86 
 
 
289 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  34.27 
 
 
296 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.25 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0514  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.28 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  37.24 
 
 
291 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  34.88 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02040  gluconolactonase  35 
 
 
298 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  30.38 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  40.12 
 
 
295 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4224  gluconolactonase  40.87 
 
 
308 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  33.2 
 
 
309 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3180  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  34.04 
 
 
346 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.67 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  30.38 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.72 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  30.38 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3831  senescence marker protein-30 (SMP-30)  35.56 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  31.1 
 
 
300 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  34.93 
 
 
280 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4759  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.85 
 
 
288 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0419  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.98 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4143  gluconolactonase  37.11 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2536  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.33 
 
 
346 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.64 
 
 
300 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.64 
 
 
300 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  37.11 
 
 
292 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  30.54 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3544  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.38 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0286848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  29.69 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01688  calcium homeostasis protein Regucalcin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08610)  29.67 
 
 
442 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.861839  normal  0.297769 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.39 
 
 
293 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  39.27 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  37.32 
 
 
303 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.12 
 
 
293 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3297  response regulator receiver protein  33.56 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.818338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2571  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.77 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233694  normal  0.0110739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2084  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  42.22 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206563  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2670  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.28 
 
 
574 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142476  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29900  gluconolactonase  39.77 
 
 
283 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0784  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.55 
 
 
302 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.13 
 
 
312 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.05 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.22 
 
 
304 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5696  calcium-binding protein  35.62 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.086452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2637  senescence marker protein-30 family protein  36.27 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0164591  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3491  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  32.47 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.62 
 
 
285 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.1 
 
 
574 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2259  gluconolactonase  32.55 
 
 
315 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0162749  unclonable  0.0000000178231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.1 
 
 
292 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4633  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.87 
 
 
335 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  32.42 
 
 
295 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1240  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.34 
 
 
286 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.138164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  33.33 
 
 
297 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.82 
 
 
280 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.99 
 
 
304 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.48 
 
 
301 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.48 
 
 
301 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51450  gluconolactonase  34.42 
 
 
284 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3078  gluconolactonase  29.73 
 
 
290 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118457  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0125  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.22 
 
 
286 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00470  conserved hypothetical protein  30.04 
 
 
315 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.51 
 
 
299 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.89 
 
 
309 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2046  putative Smp-30/Cgr1 family protein  29.97 
 
 
395 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00767899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2130  Smp-30/Cgr1 family protein, putative  29.97 
 
 
395 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.111532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.94 
 
 
302 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5175  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.33 
 
 
296 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0979633  normal  0.105367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>