More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0776 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  100 
 
 
448 aa  894  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  64.89 
 
 
450 aa  610  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  48.11 
 
 
457 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 
458 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  49.3 
 
 
458 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  48.83 
 
 
458 aa  431  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 
458 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  48.83 
 
 
458 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 
453 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.66532e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  48.13 
 
 
457 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 
458 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 
484 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  43.88 
 
 
450 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  44.24 
 
 
449 aa  415  1e-115  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  45.33 
 
 
448 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 
459 aa  413  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02144e-10 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  44.69 
 
 
452 aa  415  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  43.75 
 
 
454 aa  415  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.69 
 
 
450 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 
453 aa  407  1e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  43.37 
 
 
460 aa  408  1e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85269e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  46.23 
 
 
454 aa  407  1e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  46.23 
 
 
454 aa  407  1e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  46.85 
 
 
457 aa  405  1e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  42.29 
 
 
453 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  42.44 
 
 
452 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.28 
 
 
457 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  44.77 
 
 
455 aa  400  1e-110  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  45.52 
 
 
457 aa  400  1e-110  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  42.52 
 
 
453 aa  400  1e-110  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  43.65 
 
 
451 aa  400  1e-110  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.21912e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  41.75 
 
 
452 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  43.76 
 
 
458 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  43.15 
 
 
448 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  47.8 
 
 
457 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  43.27 
 
 
457 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  47.4 
 
 
454 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  43.36 
 
 
456 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  46.28 
 
 
454 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  44.49 
 
 
470 aa  392  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  43.82 
 
 
453 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 
449 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  39.83 
 
 
467 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  48.38 
 
 
457 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  43.96 
 
 
457 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  40.75 
 
 
465 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  39.91 
 
 
466 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  42.6 
 
 
455 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  43.97 
 
 
449 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2606  DNA repair protein RadA  43.56 
 
 
460 aa  388  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  40.65 
 
 
451 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  43.27 
 
 
451 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.62714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  42.56 
 
 
458 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  40.35 
 
 
466 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  45.65 
 
 
453 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1443  DNA repair protein RadA  45.25 
 
 
454 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  39.96 
 
 
462 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  41.1 
 
 
476 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  40.35 
 
 
466 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  41.41 
 
 
452 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 
453 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 
463 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 
453 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  41.41 
 
 
452 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  41.97 
 
 
457 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 
456 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  41.39 
 
 
446 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  3.14277e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  40.52 
 
 
448 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  41.98 
 
 
447 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  40.83 
 
 
461 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  41.46 
 
 
454 aa  377  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  41.1 
 
 
445 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  43.99 
 
 
462 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  44.04 
 
 
448 aa  375  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  42.06 
 
 
450 aa  372  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  44.06 
 
 
453 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  40.97 
 
 
455 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  39.64 
 
 
464 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0571  DNA repair protein RadA  44.55 
 
 
494 aa  375  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  44.39 
 
 
446 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  44.11 
 
 
456 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1803  DNA repair protein RadA  43.05 
 
 
452 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 
455 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  42.23 
 
 
454 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  46.23 
 
 
460 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  40.51 
 
 
455 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  45.82 
 
 
450 aa  370  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  40.33 
 
 
451 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  43.91 
 
 
464 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  44.02 
 
 
462 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  40.65 
 
 
455 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  41.55 
 
 
475 aa  372  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  38.78 
 
 
462 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  41.24 
 
 
461 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  38.9 
 
 
463 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>