More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0737 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.11 
 
 		 223 aa  338  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 228 aa  231  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 224 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 224 aa  223  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  45.81 
 
 		 229 aa  208  5e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  49.1 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  44.64 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 226 aa  204  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  43.86 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  45.58 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 246 aa  197  7.999999999999999e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.5 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  45.29 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 273 aa  192  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  39.38 
 
 		 247 aa  191  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 239 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 246 aa  190  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  42.41 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.05 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.7 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.23 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 235 aa  187  8e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 240 aa  187  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  43.67 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  41.92 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  42.6 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  40.36 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.43 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  41.92 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  41.92 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  41.92 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  41.92 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  41.92 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  41.92 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.86 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  41.92 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  41.92 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 248 aa  185  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 242 aa  185  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 233 aa  184  7e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>