164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5777 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  272  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  34.82 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  42.59 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  44.57 
 
 		 1096 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  38.05 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 1111 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  37.25 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 1096 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  37.25 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  36.04 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  45.1 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  37.62 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  46.99 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  47.56 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0073  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  41.41 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  44.94 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  44.32 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 631 aa  60.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 602 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  28.69 
 
 		 844 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  41.3 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  39.8 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  44.87 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  43.04 
 
 		 852 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  43.37 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  39.58 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  33.02 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  39.77 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  37.8 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.64 
 
 		 846 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  37.65 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 559 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  30.58 
 
 		 856 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1262  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  35.06 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2922  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.14 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  35.78 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  39.24 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2345  response regulator receiver domain-containing protein  34.68 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.71 
 
 		 384 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.26 
 
 		 844 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  38.89 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  33.64 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  38.55 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  36.26 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  39.76 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.57 
 
 		 384 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.57 
 
 		 384 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  36.59 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2091  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.494931  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2179  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.896157  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 639 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  33.96 
 
 		 856 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.96 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  32.14 
 
 		 842 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  28.33 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  35.96 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.33 
 
 		 847 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5902  response regulator receiver and SARP domain protein  29.81 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.52 
 
 		 471 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.231326 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>