84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5260 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  100 
 
 
405 aa  838    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  63.41 
 
 
403 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  54.55 
 
 
814 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  51.69 
 
 
394 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  50.64 
 
 
397 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  49.87 
 
 
420 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  50.56 
 
 
394 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  52.03 
 
 
376 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  53.15 
 
 
412 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  47.67 
 
 
422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  46.81 
 
 
783 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  44.65 
 
 
783 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  45.8 
 
 
385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  45.58 
 
 
1293 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  45.26 
 
 
382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  38.46 
 
 
443 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  32.25 
 
 
443 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  26.98 
 
 
388 aa  149  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
398 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  25.46 
 
 
434 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
390 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  32.04 
 
 
751 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  26.84 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  26.79 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  31.38 
 
 
392 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  32.13 
 
 
392 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  31.77 
 
 
392 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  33.04 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  34.11 
 
 
741 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  34.22 
 
 
754 aa  116  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  27.34 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
394 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
397 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.73 
 
 
427 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  23.73 
 
 
427 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
728 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
390 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
728 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 
378 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
729 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  25.51 
 
 
391 aa  96.3  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
903 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
382 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  26.57 
 
 
1119 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
705 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  30.05 
 
 
370 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.24 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  38.79 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.37 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
388 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  27.34 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.07 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  28.11 
 
 
942 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  29.34 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  33 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  26.96 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  25.26 
 
 
726 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  31.03 
 
 
400 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  23.14 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  30.51 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
391 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.43 
 
 
394 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3173  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
370 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
395 aa  43.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>