More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4273 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
441 aa  911    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  46.99 
 
 
414 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  41.06 
 
 
422 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.22 
 
 
423 aa  275  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 
420 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 
418 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
417 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 
431 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  34.83 
 
 
2401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
430 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
428 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
417 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  34.59 
 
 
405 aa  207  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  37.34 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
440 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3356  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
430 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.25857  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
406 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  29.32 
 
 
432 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
404 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
412 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0759  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
424 aa  154  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241053  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  30.86 
 
 
400 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
416 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
746 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.94 
 
 
379 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
362 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2121  glycosyltransferase-like protein  25.45 
 
 
391 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.41241  normal  0.565016 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1584  putative glycosyl transferase  26.41 
 
 
405 aa  94  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1600  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaC  29.63 
 
 
405 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1175  putative glycosyl transferase  27.19 
 
 
405 aa  93.2  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2992  putative glycosyl transferase  29.3 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229268 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01963  predicted glycosyl transferase  27.19 
 
 
405 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01952  hypothetical protein  27.19 
 
 
405 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2350  putative glycosyl transferase  27.19 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1005  putative glycosyl transferase  27.9 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  29.3 
 
 
360 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2671  putative glycosyl transferase  28.52 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
396 aa  88.2  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2339  putative glycosyl transferase  27.14 
 
 
405 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.225754  normal  0.701653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2346  putative glycosyl transferase  27.14 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.31761  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2295  putative glycosyl transferase  27.51 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0600773  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0507  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2238  putative glycosyl transferase  27.14 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2453  putative glycosyl transferase  27.51 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.449849  normal  0.0475636 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
539 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.64 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  27.83 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.32 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
424 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  38.79 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.82 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  28.99 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.64 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  23.64 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  23.64 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.42 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  23.64 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.64 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.64 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  36.52 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2615  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  24.64 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  27.78 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.23 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
415 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
391 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>