197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0025 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0025  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 445 aa  893    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00511907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0012  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0411083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  24.75 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  24.75 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  24.81 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  24.75 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  24.81 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  24.75 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  24.75 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  24.75 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  24.75 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  24.27 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  24.27 
 
 		 492 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  24.27 
 
 		 492 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  24.54 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  24.54 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  24.05 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  25.42 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  25.42 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  25.42 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  25.42 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  25.42 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  28.5 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  24.05 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  25.25 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  24.94 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  28.06 
 
 		 457 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  25.49 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  25.35 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  23.2 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  32.62 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.62 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.62 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  25.72 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  23.69 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 547 aa  70.1  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  26.17 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  24.8 
 
 		 489 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 388 aa  67  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  23.59 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  31.88 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  24.67 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  32.61 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  23.04 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  23.23 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  32.12 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.34 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  27.82 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  32.69 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54049  acetyl-coa transporter  28.57 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.511026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  27.82 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  32.5 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33225  Acetyl-CoA transporter  25.2 
 
 		 560 aa  60.1  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.568918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1773  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  25.48 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  25.48 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  25.48 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  25.48 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  25.48 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>